当前位置:主页 > 新闻中心 >

新闻中心

NEWS INFORMATION

贝克曼助力NGS文库制备实现速度与通量的奔腾

时间:2022-01-01 21:28 点击次数:
  本文摘要:贝克曼助力NGS文库制备实现速度与通量的奔腾 NGS技能的进步加快了基因组学研究的脚步。虽然NGS技能获得了遍及的应用,但很多尝试室在NGS文库制备方面仍面对着瓶颈。文库制备前后都需要多个步骤,文库制备前包括DNA提取、定量和片段化,制备后的步骤包括文库质量评估、文库定量和归一化。 该历程繁杂,耗时耗力,在必然水平上耽搁了研究进程。作为液体处置惩罚专家,贝克曼库尔特在NGS文库制备流程方面举行了多方面的技能创新。如何实现高通量、低成本的NGS建库?

火狐体育官网登录入口

贝克曼助力NGS文库制备实现速度与通量的奔腾 NGS技能的进步加快了基因组学研究的脚步。虽然NGS技能获得了遍及的应用,但很多尝试室在NGS文库制备方面仍面对着瓶颈。文库制备前后都需要多个步骤,文库制备前包括DNA提取、定量和片段化,制备后的步骤包括文库质量评估、文库定量和归一化。

该历程繁杂,耗时耗力,在必然水平上耽搁了研究进程。作为液体处置惩罚专家,贝克曼库尔特在NGS文库制备流程方面举行了多方面的技能创新。如何实现高通量、低成本的NGS建库?NGS文库中关键Pooling步骤如何提高?别的,对于捕捉测序文库制备,贝克曼库尔特又做了哪些积极?下面我们一起来相识一下。01 单细胞文库构建方案 单细胞测序起始核酸质料少少,步骤比普通NGS繁杂,尝试周期更长,难度和风险也更大。

而液体处置惩罚专家贝克曼库尔特的 Echo硬核技能决定它很是适合解决单细胞测序中碰到的超高通量、技能机动多变、反映scale-down成本节制、交织污染等问题。据悉,Echo接纳声波能量精准地转移液体, 无需打仗和使用吸头、喷嘴或导管等东西,喷射液滴单元可以低至2.5nL。同时可实现动态液体阐发,通过声能判断液体构成身分、液体高度,进而计较向方针板中转移精确体积所需的能量,实现精确移液。

展开全文 Echo可以完成常用微量核酸扩增从添加变性剂处置惩罚、终止液处置惩罚,到Phi29酶恒温扩增等步骤,实现超小体积下的全基因组放大。同时, 声波移液还能完成单细胞NGS文库的制备。以SMART-Seq cDNA文库制备为例,操纵Echo将SMART-Seq反映体系(50 uL)缩小4,5,8,10,16,20至32倍,Nextera XT 试剂盒缩小10倍(50 uL至5 ul)使用。

所有反映均可以或许得到足够下游上机测序的文库。图:接纳Echo完成的微量化单细胞RNA-seq NGS文库制备流程。点击检察:DO MORE with LESS | 用声波玩转单细胞测序 02 IDT文库构建方案 二代测序成本虽然已经下降了几个数量级,可是其样本文库制备的成本仍然奋发,且历程庞大。

基于此需求, 贝克曼库尔特创新推出Biomek i5+Echo 525超高通量自动化整合系统,可帮忙研究人员实现二代测序文库构建中高通量和低成本。研究团队操纵3种差别的微生物样品类型(蜡状芽孢杆菌、大肠埃希氏菌、红球菌)举行尝试,测试了该微量化方法的有效性。Biomek i5+Echo 525 整合系统的微量化文库制备方案可 将反映体系缩小20倍,降低每次反映的试剂成本; 可单次处置惩罚384个样品,提高样品处置惩罚通量。

火狐体育官网登录入口

该系统完成384个样品的文库制备 仅需4小时,该时间包括了试剂分装和孵育。别的,Echo + Biomek自动化NGS建库方案还具有精准的纳进级至微进级移液技能及自动化处置惩罚;向导式软件操作界面和台面自动校对功效;强大的数据追踪系统等特点,以包管研究得到真实成果,减少工钱操作失误。

点击检察:Biomek+Echo高通量、低成本NGS建库的法门 03 NGS文库Pooling Pooling是测序文库上机前的临门一脚。Pooling尝试凡是由两位操作者协作,将文库归一化到必然浓度,将归并测序的文库混淆,手工完成归一化和Pooling需耗时长达3小时。此刻,接纳Echo声波移液系统, 12分钟即可完成384个文库Pooling,且不需要麋集的吸液移液操作,省时省力。据先容,Echo通过聚焦声波能量转移低至2.5nL的样品,不需要吸头,无物理打仗。

高浓度文库不需分外稀释,可每秒传输几百个液滴实现nL至uL级液滴转移,将浓度归一化和Pooling简化为一步举行。Echo可以微量化反映体系将样品从微孔板任意孔快速转移到目的板任意孔。在基因组学及合成生物学中,可被应用到微量化NGS建库和快速Pooling文库、引物、寡聚核苷酸探针。

图:接纳Echo比力384个文库的200nL/文库等体积混样和等摩尔量混样。成果显示经Echo Pooling后文库得到越发均一的测序量。别的,Echo可关联输入文件,软件自动完成高通量Pooling,并完成384孔甚至1536孔每板的超高通量微量化文库质控定量。文库定量的微量化可以或许减少试剂耗损,有效节制成本。

别的,Echo支持在软件中以表单的形式挑选某些文库做qPCR。整个尝试历程数据可循,制止手工操作的窜孔等错误。图:接纳Echo完成文库定量,微量化反映体系至2uL、4uL及8uL绘制校准曲线。

点击检察:12分钟Pooling 384个NGS文库 04 捕捉测序文库制备 方针区域捕捉测序技能可针对方针区域深度测序,增加了查抄灵敏度和精确性,既能满意研究需求,又降低了测序成本,在科研、临床中均备受存眷。贝克曼库尔特推出的Biomek自动化捕捉测序方案,即可帮忙实现自动化、尺度化的捕捉测序。由自动化事情站举行基因捕捉,可以减少手工操作时间,提高事情效率,增加成果的反复性和均一性。Biomek事情站可实现从核酸提取、文库构建、定量混样到捕捉的整体尝试流程。

图:捕捉测序文库构建自动化流程。今朝,在Biomek乐成自动化的杂交捕捉试剂盒包括Agilent、Illumina、NEB、Roche等公司的产物。

别的,在Biomek向导式软件操作界面上,用户可以选择样本数量,是否使用台面整合的PCR仪,以及运行事情流程的哪个部门。该系统具备台面自动校对功效,自动鉴定耗材摆放是否正确并举行提示。点击检察:液体处置惩罚专家如何自动化、尺度化捕捉测序文库制备 点击阅读原文填写问卷,下载捕捉测序文库构建自动化方案返回,检察更多。


本文关键词:贝克,曼,助力,NGS,文库,制备,实现,火狐体育官网登录入口,速度,与

本文来源:火狐体育官网登录入口-www.baoleixf.com

Copyright © 2009-2021 www.baoleixf.com. 火狐体育官网登录入口科技 版权所有 备案号:ICP备41961612号-7

在线客服 联系方式 二维码

服务热线

012-41126373

扫一扫,关注我们